More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2459 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.33 
 
 		 668 aa  732    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.42 
 
 		 669 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.85 
 
 		 663 aa  663    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.85 
 
 		 663 aa  663    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.85 
 
 		 663 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.57 
 
 		 668 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 662 aa  664    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.42 
 
 		 669 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.3 
 
 		 659 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 		 668 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.1 
 
 		 667 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.73 
 
 		 631 aa  933    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.5 
 
 		 666 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 		 668 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.9 
 
 		 674 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.05 
 
 		 595 aa  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.92 
 
 		 619 aa  892    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.33 
 
 		 668 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.24 
 
 		 674 aa  729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  70.03 
 
 		 614 aa  873    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.42 
 
 		 669 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 		 668 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 		 668 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.5 
 
 		 668 aa  674    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.5 
 
 		 666 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.76 
 
 		 669 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.4 
 
 		 668 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.15 
 
 		 672 aa  681    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.37 
 
 		 618 aa  876    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  66.17 
 
 		 619 aa  844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 		 668 aa  733    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.01 
 
 		 662 aa  693    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.48 
 
 		 679 aa  720    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.65 
 
 		 668 aa  722    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.84 
 
 		 661 aa  671    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.25 
 
 		 669 aa  726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.43 
 
 		 612 aa  1106    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.69 
 
 		 662 aa  686    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 605 aa  1239    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.67 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.7 
 
 		 584 aa  359  8e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.85 
 
 		 567 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.45 
 
 		 582 aa  350  4e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.05 
 
 		 581 aa  350  4e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.95 
 
 		 581 aa  350  5e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.39 
 
 		 585 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  37.06 
 
 		 570 aa  347  4e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.98 
 
 		 575 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.98 
 
 		 575 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.29 
 
 		 567 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 566 aa  344  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.58 
 
 		 578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  37.18 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.02 
 
 		 567 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 567 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  35.82 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.49 
 
 		 599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.21 
 
 		 567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.47 
 
 		 603 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.41 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.41 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.63 
 
 		 583 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.58 
 
 		 596 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.41 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.49 
 
 		 566 aa  333  4e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.77 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.77 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.82 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  38.06 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.38 
 
 		 567 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.83 
 
 		 605 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 		 605 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.64 
 
 		 591 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.77 
 
 		 605 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.91 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.54 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.15 
 
 		 583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.61 
 
 		 605 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.95 
 
 		 606 aa  327  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.53 
 
 		 617 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.26 
 
 		 598 aa  326  6e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.84 
 
 		 598 aa  326  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.84 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.54 
 
 		 587 aa  326  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.46 
 
 		 608 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.98 
 
 		 594 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 592 aa  326  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 		 575 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 592 aa  326  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 592 aa  326  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.81 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 592 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.88 
 
 		 591 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.99 
 
 		 575 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.63 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.87 
 
 		 607 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.96 
 
 		 596 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.96 
 
 		 596 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>