More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0127 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.17 
 
 		 668 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.19 
 
 		 666 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.65 
 
 		 663 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.17 
 
 		 669 aa  718    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.65 
 
 		 663 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.17 
 
 		 669 aa  718    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.08 
 
 		 668 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.5 
 
 		 662 aa  666    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.05 
 
 		 595 aa  688    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.01 
 
 		 668 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.81 
 
 		 659 aa  673    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.43 
 
 		 605 aa  1106    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  70.42 
 
 		 631 aa  923    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  57 
 
 		 669 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.76 
 
 		 674 aa  712    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.65 
 
 		 663 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.04 
 
 		 614 aa  863    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.86 
 
 		 618 aa  871    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  68.97 
 
 		 619 aa  875    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.52 
 
 		 668 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.67 
 
 		 668 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.67 
 
 		 668 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.35 
 
 		 666 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.7 
 
 		 669 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.95 
 
 		 667 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.5 
 
 		 668 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.86 
 
 		 662 aa  678    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.82 
 
 		 674 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  66.01 
 
 		 619 aa  848    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.87 
 
 		 661 aa  678    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.58 
 
 		 668 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 662 aa  682    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.01 
 
 		 668 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.17 
 
 		 669 aa  718    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.92 
 
 		 679 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.81 
 
 		 668 aa  665    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.04 
 
 		 672 aa  687    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.17 
 
 		 668 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 612 aa  1249    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.43 
 
 		 585 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.75 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.99 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.16 
 
 		 567 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.11 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 575 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 575 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.18 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.78 
 
 		 581 aa  346  7e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.61 
 
 		 567 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  36.32 
 
 		 573 aa  345  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  39.11 
 
 		 583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  36.98 
 
 		 567 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  38.94 
 
 		 567 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.62 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.23 
 
 		 603 aa  340  5.9999999999999996e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.45 
 
 		 567 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.73 
 
 		 570 aa  339  8e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  35.03 
 
 		 596 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.43 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.89 
 
 		 567 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.83 
 
 		 587 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.29 
 
 		 575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.75 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.99 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.61 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.14 
 
 		 575 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.76 
 
 		 542 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.65 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.77 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.34 
 
 		 567 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.85 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.6 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.62 
 
 		 567 aa  331  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.13 
 
 		 591 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.01 
 
 		 606 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.74 
 
 		 602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.29 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.39 
 
 		 583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.98 
 
 		 592 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.36 
 
 		 617 aa  328  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.14 
 
 		 583 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  37.98 
 
 		 584 aa  327  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.26 
 
 		 592 aa  326  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.24 
 
 		 605 aa  326  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.87 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.15 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.27 
 
 		 590 aa  326  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.82 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  35.15 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.63 
 
 		 601 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.04 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  35.31 
 
 		 647 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 604 aa  322  9.000000000000001e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.77 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.22 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>