More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0857 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  52.34 
 
 		 614 aa  658    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.51 
 
 		 674 aa  816    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.81 
 
 		 669 aa  818    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.61 
 
 		 663 aa  1061    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.12 
 
 		 668 aa  828    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.81 
 
 		 669 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.69 
 
 		 668 aa  823    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.26 
 
 		 659 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.69 
 
 		 668 aa  822    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  72.04 
 
 		 661 aa  1030    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 631 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.45 
 
 		 663 aa  1059    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  75 
 
 		 668 aa  1059    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.64 
 
 		 667 aa  767    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.3 
 
 		 663 aa  1056    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.39 
 
 		 668 aa  820    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.42 
 
 		 668 aa  822    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.51 
 
 		 669 aa  817    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 662 aa  1374    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.42 
 
 		 666 aa  823    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  78.25 
 
 		 662 aa  1122    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 		 668 aa  828    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.49 
 
 		 672 aa  1102    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 		 668 aa  828    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.45 
 
 		 666 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.12 
 
 		 669 aa  815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.97 
 
 		 674 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.97 
 
 		 618 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 619 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.42 
 
 		 668 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.81 
 
 		 669 aa  818    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  79.61 
 
 		 662 aa  1134    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 		 679 aa  823    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 605 aa  669    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.54 
 
 		 668 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.5 
 
 		 612 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.69 
 
 		 668 aa  822    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  50.4 
 
 		 619 aa  631  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  48.81 
 
 		 595 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.35 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.52 
 
 		 585 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.87 
 
 		 596 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.37 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.19 
 
 		 596 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.91 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.95 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.41 
 
 		 568 aa  349  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.54 
 
 		 596 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.81 
 
 		 581 aa  347  3e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.11 
 
 		 598 aa  348  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.75 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.46 
 
 		 582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  35.86 
 
 		 638 aa  344  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.8 
 
 		 581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.66 
 
 		 567 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.77 
 
 		 598 aa  343  7e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.81 
 
 		 575 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.7 
 
 		 567 aa  343  9e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.52 
 
 		 568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.08 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.7 
 
 		 578 aa  336  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.09 
 
 		 605 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 596 aa  334  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.91 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.78 
 
 		 596 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 		 605 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  38.03 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.37 
 
 		 597 aa  330  7e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 567 aa  329  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.54 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.54 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.13 
 
 		 611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.26 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.9 
 
 		 575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.21 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  35.46 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.07 
 
 		 600 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.38 
 
 		 603 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  36.91 
 
 		 572 aa  327  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.87 
 
 		 612 aa  327  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.97 
 
 		 584 aa  326  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.01 
 
 		 595 aa  327  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.88 
 
 		 604 aa  326  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.98 
 
 		 567 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.22 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.22 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  36.48 
 
 		 647 aa  324  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.78 
 
 		 583 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.19 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  36.58 
 
 		 567 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 587 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.14 
 
 		 577 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.52 
 
 		 567 aa  323  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.32 
 
 		 583 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 592 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.14 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0088  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.06 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>