More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3621 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.86 
 
 
668 aa  1310    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.13 
 
 
668 aa  851    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.92 
 
 
672 aa  870    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
663 aa  853    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  96.26 
 
 
668 aa  1345    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.96 
 
 
669 aa  1189    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
659 aa  830    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.68 
 
 
674 aa  1231    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
663 aa  853    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.54 
 
 
618 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.17 
 
 
605 aa  733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.59 
 
 
631 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.86 
 
 
668 aa  1309    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.52 
 
 
619 aa  693    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 
662 aa  823    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.48 
 
 
661 aa  875    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.44 
 
 
667 aa  845    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.66 
 
 
669 aa  1188    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.61 
 
 
668 aa  1319    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.51 
 
 
668 aa  1235    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
668 aa  1382    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.94 
 
 
666 aa  1222    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
668 aa  1382    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.39 
 
 
595 aa  660    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.81 
 
 
666 aa  1190    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.68 
 
 
669 aa  1194    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.56 
 
 
668 aa  1307    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.87 
 
 
674 aa  1241    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.1 
 
 
614 aa  738    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.85 
 
 
619 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  98.95 
 
 
668 aa  1372    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.71 
 
 
668 aa  1308    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.01 
 
 
662 aa  865    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.91 
 
 
679 aa  1202    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
663 aa  853    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.96 
 
 
669 aa  1189    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.67 
 
 
612 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.96 
 
 
669 aa  1189    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.08 
 
 
662 aa  880    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.68 
 
 
584 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.05 
 
 
567 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.18 
 
 
585 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  39.03 
 
 
568 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.43 
 
 
605 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  37.4 
 
 
638 aa  362  8e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.9 
 
 
567 aa  362  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.55 
 
 
605 aa  360  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.38 
 
 
605 aa  360  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.09 
 
 
589 aa  360  6e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.09 
 
 
589 aa  360  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.38 
 
 
605 aa  359  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.17 
 
 
567 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 
567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.99 
 
 
588 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.5 
 
 
579 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.15 
 
 
608 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.57 
 
 
566 aa  356  8.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.23 
 
 
567 aa  355  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.15 
 
 
608 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.34 
 
 
598 aa  353  4e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.13 
 
 
592 aa  353  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.56 
 
 
567 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.46 
 
 
617 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.75 
 
 
595 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.67 
 
 
606 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.35 
 
 
567 aa  350  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.63 
 
 
592 aa  349  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  38.5 
 
 
647 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.21 
 
 
592 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.38 
 
 
598 aa  347  3e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.37 
 
 
612 aa  348  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.75 
 
 
578 aa  347  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.25 
 
 
597 aa  347  5e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.46 
 
 
597 aa  347  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 
592 aa  346  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
598 aa  346  8e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.94 
 
 
582 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.48 
 
 
588 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  36.64 
 
 
573 aa  345  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.29 
 
 
599 aa  346  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.13 
 
 
592 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.09 
 
 
575 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.36 
 
 
575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.26 
 
 
604 aa  344  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.25 
 
 
581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.92 
 
 
607 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
592 aa  343  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
592 aa  343  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
592 aa  343  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
592 aa  343  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.96 
 
 
595 aa  343  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.05 
 
 
596 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.57 
 
 
588 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
588 aa  342  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
603 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  36.85 
 
 
598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
589 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 
581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.07 
 
 
602 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.27 
 
 
566 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>