More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1777 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
668 aa  848    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  58.65 
 
 
661 aa  804    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.68 
 
 
663 aa  785    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.53 
 
 
663 aa  783    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.97 
 
 
668 aa  860    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
669 aa  875    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.3 
 
 
605 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.51 
 
 
668 aa  854    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
659 aa  1350    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.05 
 
 
668 aa  851    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.14 
 
 
631 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.35 
 
 
618 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.77 
 
 
662 aa  795    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
668 aa  854    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.51 
 
 
668 aa  856    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.44 
 
 
674 aa  850    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.02 
 
 
619 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 
614 aa  713    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
669 aa  875    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.05 
 
 
674 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
668 aa  854    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.26 
 
 
662 aa  760    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
669 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
668 aa  854    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
666 aa  862    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
669 aa  875    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  65.35 
 
 
667 aa  848    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.66 
 
 
668 aa  788    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.51 
 
 
668 aa  853    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
619 aa  709    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.9 
 
 
666 aa  858    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
668 aa  854    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
669 aa  875    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.22 
 
 
662 aa  797    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.89 
 
 
679 aa  871    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.68 
 
 
663 aa  785    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.81 
 
 
612 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.72 
 
 
672 aa  770    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.78 
 
 
595 aa  628  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.68 
 
 
584 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.45 
 
 
567 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.57 
 
 
567 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.78 
 
 
585 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.83 
 
 
566 aa  362  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.63 
 
 
568 aa  362  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.95 
 
 
566 aa  353  8e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  39.44 
 
 
567 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.01 
 
 
596 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.09 
 
 
579 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.99 
 
 
598 aa  348  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.99 
 
 
567 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  38.52 
 
 
567 aa  346  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.31 
 
 
605 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.34 
 
 
589 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.34 
 
 
589 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.67 
 
 
605 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.41 
 
 
595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.59 
 
 
567 aa  343  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.21 
 
 
567 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.67 
 
 
598 aa  342  9e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
575 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.05 
 
 
612 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.67 
 
 
605 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.5 
 
 
605 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.63 
 
 
567 aa  340  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.76 
 
 
596 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.69 
 
 
585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.05 
 
 
596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.56 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.35 
 
 
590 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 
596 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.96 
 
 
607 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.9 
 
 
578 aa  336  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  36.27 
 
 
594 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.26 
 
 
592 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.05 
 
 
595 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.7 
 
 
597 aa  334  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.11 
 
 
575 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.39 
 
 
611 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.81 
 
 
607 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
604 aa  333  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.89 
 
 
596 aa  333  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.03 
 
 
568 aa  333  7.000000000000001e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.51 
 
 
592 aa  333  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.02 
 
 
591 aa  333  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
591 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.59 
 
 
577 aa  332  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.35 
 
 
595 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
591 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.33 
 
 
612 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 
591 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
591 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 
591 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 
588 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  34.94 
 
 
596 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.1 
 
 
607 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
591 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>