More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0619 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 410 aa  843    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  57.88 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  40.1 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  35.94 
 
 		 723 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  34.66 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  33.01 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.5 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  31.37 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  32.6 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  33.17 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  32.85 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.86 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  28.47 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  29.43 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.5 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.81 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.92 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  27.73 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.98 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.76 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.6 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.6 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.83 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  26.4 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.16 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.63 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.96 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.96 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.55 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.86 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  27.65 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.51 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.72 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  27.24 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.26 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  28.46 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.84 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.48 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  26.67 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 		 914 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 		 900 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.37 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.54 
 
 		 1099 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.18 
 
 		 1099 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.32 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  27.92 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2193  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.27 
 
 		 1082 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442347  normal  0.129534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.55 
 
 		 1084 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2867  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.55 
 
 		 1084 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00982729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4434  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1084 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.901891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1726  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.56 
 
 		 1081 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.746976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1263  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1084 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522789  normal  0.213082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2781  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1084 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0855395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0811  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1084 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1292  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1084 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.81 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.72 
 
 		 894 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.01 
 
 		 1082 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.03 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  29.97 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.53 
 
 		 924 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2034  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.01 
 
 		 1081 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1521  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.1 
 
 		 1081 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  23.59 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.4 
 
 		 926 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0772  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.494856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1610  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0566  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0585  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0102976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1507  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1477  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  27.6 
 
 		 267 aa  67  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.55 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0874  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.66 
 
 		 1084 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.176638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0583  MGS domain protein  23.98 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.774187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.36 
 
 		 1072 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  23.16 
 
 		 904 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  22.55 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  23.16 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4931  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.03 
 
 		 1052 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  23.04 
 
 		 912 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.33 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1612  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.84 
 
 		 1084 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  27.24 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.89 
 
 		 1106 aa  63.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.17 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  21.69 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  23.11 
 
 		 2333 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  27.09 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1458  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.67 
 
 		 1083 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  25.23 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2390  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.67 
 
 		 1053 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.08 
 
 		 1070 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1592  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.54 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.430094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2028  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.66 
 
 		 1084 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0586  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 		 1076 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1732  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.49 
 
 		 1076 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>