More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0871 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
694 aa  1391    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
698 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 
696 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
682 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
712 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  46.98 
 
 
701 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
686 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
709 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  45.95 
 
 
707 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
724 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
708 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
702 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  44.99 
 
 
708 aa  562  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
702 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
658 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.83 
 
 
693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
679 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
652 aa  512  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  43.53 
 
 
686 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  42.71 
 
 
681 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
688 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
679 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
691 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  42.05 
 
 
685 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
794 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  39.37 
 
 
700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.96 
 
 
705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
654 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
699 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.21 
 
 
741 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  35.57 
 
 
714 aa  438  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
732 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  37.01 
 
 
720 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  35.9 
 
 
733 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
686 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.67 
 
 
697 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
756 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
733 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.13 
 
 
720 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
747 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
677 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  36.08 
 
 
684 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
707 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 
660 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
702 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.02 
 
 
703 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
695 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
759 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
682 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
694 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.62 
 
 
681 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.24 
 
 
715 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
714 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
702 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
681 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.92 
 
 
669 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  34.38 
 
 
711 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
760 aa  363  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.5 
 
 
685 aa  362  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  34.29 
 
 
672 aa  360  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  33.1 
 
 
691 aa  360  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
735 aa  358  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.67 
 
 
784 aa  357  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.37 
 
 
662 aa  356  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
671 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
675 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  34.71 
 
 
783 aa  351  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  35.36 
 
 
678 aa  350  6e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
655 aa  349  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.67 
 
 
655 aa  346  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 
713 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
724 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
684 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
671 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
724 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
696 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  49.6 
 
 
654 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  49.07 
 
 
654 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.61 
 
 
702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.34 
 
 
806 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
684 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
728 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
658 aa  339  9e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  35.61 
 
 
662 aa  339  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  34.23 
 
 
748 aa  336  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
751 aa  336  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  34.41 
 
 
727 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
763 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.9 
 
 
717 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
701 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
758 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
686 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  34.56 
 
 
717 aa  331  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
691 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  33.42 
 
 
758 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 
677 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>