More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_775 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  80.68 
 
 		 981 aa  1608    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  100 
 
 		 974 aa  1965    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  80.39 
 
 		 974 aa  1540    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  24.16 
 
 		 945 aa  237  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  24.16 
 
 		 945 aa  237  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  24.21 
 
 		 1041 aa  233  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.17 
 
 		 967 aa  226  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  22.52 
 
 		 944 aa  220  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.81 
 
 		 1054 aa  207  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  28.81 
 
 		 1040 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  23.04 
 
 		 945 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.66 
 
 		 1049 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  26.67 
 
 		 1013 aa  186  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  29.55 
 
 		 1026 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  28.22 
 
 		 1109 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  28.22 
 
 		 1109 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.45 
 
 		 1068 aa  174  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30 
 
 		 882 aa  174  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 713 aa  171  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  24.49 
 
 		 1011 aa  168  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.45 
 
 		 1146 aa  168  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  33.13 
 
 		 1077 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  26.24 
 
 		 726 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  27.22 
 
 		 1038 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  38.67 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  38.67 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  38.67 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  38.67 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  38.22 
 
 		 743 aa  157  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  38.67 
 
 		 743 aa  157  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.34 
 
 		 723 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 709 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  38.96 
 
 		 743 aa  155  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  33.66 
 
 		 1002 aa  155  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  33.94 
 
 		 702 aa  155  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  38.22 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  38.67 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  25.87 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  27.7 
 
 		 1038 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  28.54 
 
 		 1038 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  33.13 
 
 		 1062 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  33.13 
 
 		 1062 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.02 
 
 		 1001 aa  150  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  38.62 
 
 		 998 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  38.62 
 
 		 998 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  38.62 
 
 		 998 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.55 
 
 		 730 aa  150  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  39.39 
 
 		 339 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.19 
 
 		 697 aa  148  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  38.21 
 
 		 1000 aa  147  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1041 aa  146  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  23.96 
 
 		 1003 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  42.37 
 
 		 682 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  37 
 
 		 750 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  30.53 
 
 		 714 aa  145  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  38.77 
 
 		 699 aa  145  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  36.84 
 
 		 576 aa  145  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  40.54 
 
 		 733 aa  144  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  27.7 
 
 		 810 aa  144  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  23.92 
 
 		 1013 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1002 aa  144  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  41.08 
 
 		 753 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  27.64 
 
 		 1038 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.73 
 
 		 712 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 747 aa  143  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  27.27 
 
 		 1038 aa  142  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  25.16 
 
 		 745 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  37.44 
 
 		 714 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  24.34 
 
 		 1089 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1246 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  37.44 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  31.75 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  34.8 
 
 		 764 aa  139  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  43.78 
 
 		 737 aa  138  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  36.99 
 
 		 699 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  31.3 
 
 		 962 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  33.21 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  42.7 
 
 		 701 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  23.97 
 
 		 1028 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  23.6 
 
 		 1040 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  23.55 
 
 		 681 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  37.84 
 
 		 706 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  40.54 
 
 		 673 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  34.8 
 
 		 699 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  37.56 
 
 		 712 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  34.63 
 
 		 780 aa  131  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  32.93 
 
 		 1022 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  32.93 
 
 		 1022 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  31.09 
 
 		 941 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  22.63 
 
 		 955 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  22.63 
 
 		 955 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  22.63 
 
 		 955 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  24.52 
 
 		 948 aa  127  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  25.42 
 
 		 958 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  31.4 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  32.62 
 
 		 775 aa  126  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  32.43 
 
 		 730 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  38.77 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  39.47 
 
 		 777 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  28.19 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>