More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3294 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 
870 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  42.43 
 
 
868 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 
868 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  42.21 
 
 
868 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  42.74 
 
 
869 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  43.09 
 
 
869 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 
874 aa  701    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
837 aa  1708    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  42.37 
 
 
868 aa  678    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  42.56 
 
 
868 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 
868 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  41.89 
 
 
871 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  43.59 
 
 
866 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  42.52 
 
 
868 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 
842 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 
868 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  42.51 
 
 
865 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 
890 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  36.63 
 
 
891 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.7 
 
 
887 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.18 
 
 
903 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 
907 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.34 
 
 
887 aa  351  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.17 
 
 
867 aa  348  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.14 
 
 
873 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.66 
 
 
950 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.64 
 
 
826 aa  316  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  33.56 
 
 
886 aa  314  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  31.95 
 
 
906 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.48 
 
 
821 aa  301  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.4 
 
 
891 aa  278  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  28.31 
 
 
825 aa  271  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.74 
 
 
840 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.66 
 
 
869 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.97 
 
 
889 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.87 
 
 
884 aa  241  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  30.26 
 
 
971 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 
341 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.82 
 
 
971 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.13 
 
 
971 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.02 
 
 
302 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.04 
 
 
754 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  39.42 
 
 
781 aa  183  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  38.8 
 
 
762 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 
758 aa  180  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 
799 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  27.47 
 
 
835 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.39 
 
 
811 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.88 
 
 
758 aa  177  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  35.37 
 
 
758 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 
761 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
788 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 
758 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  37.07 
 
 
780 aa  174  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
769 aa  174  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
758 aa  173  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
810 aa  173  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
785 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 
824 aa  173  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.89 
 
 
835 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
761 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.09 
 
 
902 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 
758 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  34.04 
 
 
757 aa  170  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  35.49 
 
 
809 aa  170  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  34.91 
 
 
764 aa  168  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.13 
 
 
760 aa  168  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 
786 aa  167  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  36.78 
 
 
782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  36.69 
 
 
800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 
762 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  36.76 
 
 
789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  37.76 
 
 
275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  36.65 
 
 
789 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  36.28 
 
 
758 aa  162  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 
812 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.79 
 
 
779 aa  161  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
789 aa  161  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  38.26 
 
 
364 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.96 
 
 
785 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
789 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
789 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
789 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  35.53 
 
 
789 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  35.53 
 
 
789 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  35.53 
 
 
789 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  34.94 
 
 
789 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 
792 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.6 
 
 
852 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
809 aa  157  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
790 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
796 aa  157  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 
791 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  38.26 
 
 
382 aa  156  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 
791 aa  155  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  35.91 
 
 
790 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
787 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  35.53 
 
 
808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 
797 aa  154  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>