More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2199 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.68 
 
 		 589 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  45.8 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.84 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 234 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 255 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.13 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.17 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.33 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  26.27 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 		 232 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 234 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 229 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  35.48 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.5 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 212 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 224 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  31.35 
 
 		 234 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.86 
 
 		 236 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.55 
 
 		 238 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 231 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.21 
 
 		 233 aa  96.7  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 715 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  36.26 
 
 		 241 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 139 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 		 352 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 228 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  36.43 
 
 		 229 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 228 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 229 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 234 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  29.79 
 
 		 240 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.73 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  31.02 
 
 		 229 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.02 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 231 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 231 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 134 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 246 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 246 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 233 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 		 403 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 232 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  34.36 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  38.36 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 231 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 443 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.56 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 228 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.38 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  32.42 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 		 228 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  39.5 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 231 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 443 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 232 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  37.67 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.55 
 
 		 236 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  40.98 
 
 		 123 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  30.1 
 
 		 232 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 231 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  38.41 
 
 		 236 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 243 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  40 
 
 		 243 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 263 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>