95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2119 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2119  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 478 aa  885    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91986  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  38.35 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1523  outer membrane efflux protein  36.03 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  36.19 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  26.89 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.3 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.44 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 1496 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.82 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.82 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.83 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.36 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  25.13 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.36 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.81 
 
 		 576 aa  53.5  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  30.66 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.28 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.28 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.7 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.28 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.28 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.28 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.28 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  25 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  25.71 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  24.74 
 
 		 479 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.28 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  24.73 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.73 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.73 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.1 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.73 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.73 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1470 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  25.85 
 
 		 606 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.56 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.8 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.35 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.97 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.81 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.6 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.37 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.79 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  29.03 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.04 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 627 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.61 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.9 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  25.66 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 972 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  33.33 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.81 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2638  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.73 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 616 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  24.07 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.84 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.71 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.33 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.3 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 525 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.59 
 
 		 616 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  25.52 
 
 		 499 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.24 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.93 
 
 		 523 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  24.06 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  36.36 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  28.16 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.73 
 
 		 485 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.26 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 497 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  30.57 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>