More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0169 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 380 aa  783    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1303  LigA  57.71 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.082327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0394  hypothetical protein  56 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.55 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.92 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.69 
 
 		 377 aa  305  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  46.43 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.11 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  45.29 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.61 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.69 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.16 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.4 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.37 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  46.34 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  43.02 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 		 375 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  43.47 
 
 		 359 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 361 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  43.34 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  46.2 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  43.34 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.14 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.51 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  44.38 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.75 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  44.86 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  44.54 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  44.89 
 
 		 363 aa  292  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  45.03 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  44.78 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.62 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 347 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 364 aa  288  7e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.84 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  44.25 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.31 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  42.65 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  43.1 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  43.1 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  42.37 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  43.6 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  44.74 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  42.86 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  44.84 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  44.84 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 365 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  44.28 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  45.03 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  43.95 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.06 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  44.54 
 
 		 367 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 374 aa  285  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  44.91 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  41.04 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.84 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.13 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  48.81 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  44.92 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.13 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  44.6 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  42.43 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  45.13 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  44.25 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  44.84 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 381 aa  281  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  40.75 
 
 		 364 aa  282  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  46.34 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  44.84 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  42.44 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  44.84 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  51.29 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>