More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5659 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 329 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  41.77 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1931  FecR protein  40.81 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.167252  normal  0.0413006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  32.22 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  26.33 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  25.97 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  34.04 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  29.2 
 
 		 351 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  35.26 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  30.93 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  29.62 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.99 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  32.89 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.83 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  28.73 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  31.32 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  27.04 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0254  FecR protein  25.47 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  26.11 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  31.22 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  31.9 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  26.65 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  33.56 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  31.74 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  27.56 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  31.98 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  25.61 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  41.94 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  27.17 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 392 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1566  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  29.59 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 411 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1496  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 348 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 383 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  26.79 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2767  anti-FecI sigma factor, FecR  25.51 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  28.76 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  36.89 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  37.09 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0658  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  34.97 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2895  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459828  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  26.12 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  28.08 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  41.67 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  42.71 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.23 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.05 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.28 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  29.73 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.68 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  25.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  30.59 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  33.56 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  31.02 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  30.16 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  25.91 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  45.83 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  24.04 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  30.56 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  35.4 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  25.08 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  39.06 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  42.37 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  31.84 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  31.11 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>