More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5603 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  100 
 
 		 401 aa  822    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5220  histidine kinase  40.67 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  37.44 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  35.14 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  32.2 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.32 
 
 		 1418 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5175  histidine kinase  39.92 
 
 		 291 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.61 
 
 		 810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 601 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 870 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  25.71 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  24.69 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 601 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  30.38 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 608 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0983  histidine kinase  31.36 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 915 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 607 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  32.89 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  31.87 
 
 		 646 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.41 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1120 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 634 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 846 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 959 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  29.96 
 
 		 676 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 639 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 639 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 1159 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 1029 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1044  histidine kinase  30.64 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.949503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 613 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 579 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 680 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 462 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1075 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32 
 
 		 1361 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  22.81 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  29.45 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 508 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.68 
 
 		 1162 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 604 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  32.47 
 
 		 1199 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 493 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  30.38 
 
 		 629 aa  96.3  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 691 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 975 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.49 
 
 		 560 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.06 
 
 		 1131 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  29.92 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1362 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 958 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  28.91 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0657  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 618 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  29.12 
 
 		 1351 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  26.44 
 
 		 691 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.05 
 
 		 1169 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  32.34 
 
 		 1353 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 741 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  27.64 
 
 		 1074 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  30.2 
 
 		 693 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 979 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  26.79 
 
 		 1206 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.74 
 
 		 1301 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 584 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 468 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.09 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.56 
 
 		 1355 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 788 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  27.76 
 
 		 496 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1197 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.46 
 
 		 1535 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 655 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 926 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  27.7 
 
 		 614 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 1159 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1140 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 639 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>