182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3831 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  60 
 
 		 278 aa  334  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  38.83 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  37.63 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  29.53 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  24.12 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  23.7 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.51 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.68 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  25.44 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  24.76 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  24.11 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.73 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  23.77 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  24 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  25.84 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27.15 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.1 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  22.8 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  22.69 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  23.75 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  23.4 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  23.45 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.03 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  22.97 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  22.97 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  21.37 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.74 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  22.66 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.74 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  24.04 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  21.82 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  22.85 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.58 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  25.59 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  21.53 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  22.47 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  24.84 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  22.45 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  21.21 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  24.41 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  24.26 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  23.97 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  19.44 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>