More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1706 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  100 
 
 		 319 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  37.05 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  34.07 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  36.18 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.55 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  29.28 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.79 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.79 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.79 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.79 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.79 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  29.01 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.03 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.62 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.28 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.08 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.23 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.71 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 379 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  28.03 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 		 387 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  27.07 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.37 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.87 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  28.57 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  27.4 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  26.25 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 371 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.24 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  25.81 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.36 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  28.68 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  31.84 
 
 		 823 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  28.32 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.36 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.62 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.36 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  30.27 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  25.48 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  28.63 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.54 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  30.12 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  26.8 
 
 		 387 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.96 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.38 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.28 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.28 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.28 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.28 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.28 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.96 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  27.96 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.73 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  27.96 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  27.14 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  27.59 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  26.76 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  27.21 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.72 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.52 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  26.39 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.25 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  27.43 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  24.53 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.52 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.28 
 
 		 645 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  27.43 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.32 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.61 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  26.86 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27.82 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.82 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  26.86 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.43 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  25.62 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  27.49 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.26 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.91 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  26.86 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>