295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0669 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 576 aa  1186    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  52.41 
 
 		 581 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  49.92 
 
 		 589 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  49.75 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  40.51 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  39.25 
 
 		 596 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  40.25 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  36.47 
 
 		 596 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  37.37 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  35.32 
 
 		 595 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 		 604 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  34.89 
 
 		 599 aa  349  6e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.18 
 
 		 589 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  25.25 
 
 		 610 aa  113  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.32 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  26.43 
 
 		 594 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  24.05 
 
 		 587 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  25.15 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.04 
 
 		 592 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 578 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 602 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 229 aa  90.9  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  33.95 
 
 		 218 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 		 248 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  22.92 
 
 		 504 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  23.67 
 
 		 599 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.27 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  22.6 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.5 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1137  hypothetical protein  24.93 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  21.29 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  31.38 
 
 		 239 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  32.46 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  27.94 
 
 		 605 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  21.33 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  23 
 
 		 611 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  22.85 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  21.68 
 
 		 738 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  21.57 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  41.84 
 
 		 723 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  23.84 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  22.88 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  22.52 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  25.94 
 
 		 1017 aa  60.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  21.12 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  21.12 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.82 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  27.53 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  40.82 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  40.82 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  40.82 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  22.66 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  20.6 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  21.08 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  21.52 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  21.57 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 		 1057 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  23.54 
 
 		 853 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.02 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  22.01 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  22.25 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 734 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  21.36 
 
 		 731 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  27.17 
 
 		 714 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  21.02 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  29.49 
 
 		 618 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  21.89 
 
 		 796 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 671 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  22.07 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  23.08 
 
 		 735 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  26.11 
 
 		 1048 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  20.92 
 
 		 734 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 725 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  22.72 
 
 		 790 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  21.52 
 
 		 689 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>