More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1791 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  62.75 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  60.42 
 
 		 207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  56.63 
 
 		 197 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2882  Ribonuclease H  46.6 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  58.02 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  52.79 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.03 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.26 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.83 
 
 		 255 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  48.95 
 
 		 191 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.69 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 211 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  45.64 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.5 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  47.11 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.04 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.94 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 191 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  46.77 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.69 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  43.36 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 191 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.03 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  48.26 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 206 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.89 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.52 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.96 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  40.61 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  52.06 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  44.28 
 
 		 217 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 210 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 197 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  48.29 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  43.92 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  48.34 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 338 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.8 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  43.75 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.45 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 198 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.18 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.64 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  46.11 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>