More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1285 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  259  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2988  histidine kinase  41.07 
 
 
507 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.540533  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1070 aa  80.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
530 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
947 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.3 
 
 
1177 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1433 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
823 aa  76.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1101 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1286  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  33.06 
 
 
731 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1478 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  31.36 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
964 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1040 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
924 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
653 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2004  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
656 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
666 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
666 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  35 
 
 
733 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0824  histidine kinase  36.28 
 
 
509 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.655182  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
928 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  29.51 
 
 
755 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.05 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1548 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
1007 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3276  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  33.04 
 
 
676 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
866 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.17 
 
 
1060 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
882 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  33.33 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 
763 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
664 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
643 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
663 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
862 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  31.71 
 
 
782 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1005 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
923 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
701 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
934 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
907 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
647 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1230 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
890 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  29.06 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
705 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  36.8 
 
 
908 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
865 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
672 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
923 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
647 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  34.68 
 
 
1131 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  29.06 
 
 
526 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  36.72 
 
 
910 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  31.62 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  34.17 
 
 
933 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  34.19 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
841 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
519 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1557 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  29.75 
 
 
736 aa  68.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  36.36 
 
 
958 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
624 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
923 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 
456 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
654 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
995 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  32.5 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  33.05 
 
 
598 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1629 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  32.77 
 
 
1000 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  34.48 
 
 
962 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1398 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.4 
 
 
1499 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
973 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  31.36 
 
 
1200 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
641 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 
969 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
993 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  35.78 
 
 
411 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1625 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3369  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0278306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>