232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0227 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  73.88 
 
 		 486 aa  710    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  100 
 
 		 489 aa  972    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  67.36 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  67.57 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  67.94 
 
 		 470 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  63.56 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  55.21 
 
 		 478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  57.59 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  56.07 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  55.65 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  55.65 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  55.03 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  54.17 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  55.88 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  58.06 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  54.18 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  52.67 
 
 		 527 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  53.37 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  53.78 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  53.56 
 
 		 494 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  53.37 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  52.94 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  54.64 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  52.94 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  52.94 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  53.68 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  51.67 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  52.24 
 
 		 483 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  51.12 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  47.5 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  57.07 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  47.61 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 490 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 490 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  48.65 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  48.65 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  48.65 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  46.99 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  49.48 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  48.86 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  46.11 
 
 		 487 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  52.47 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  48.12 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  44.3 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  44.99 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.54 
 
 		 537 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.18 
 
 		 555 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  29.94 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  28.92 
 
 		 559 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  28.92 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  27.15 
 
 		 599 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.29 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  27.97 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  26.82 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  26.05 
 
 		 564 aa  117  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  28.89 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  27.44 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  26.21 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  26.45 
 
 		 586 aa  113  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  26.18 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 		 692 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  31.59 
 
 		 766 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.25 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  25.85 
 
 		 692 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  31.3 
 
 		 765 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  25.71 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  25.71 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  25.71 
 
 		 692 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0894  carbon starvation protein CstA  26.84 
 
 		 592 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  24.69 
 
 		 684 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  26.34 
 
 		 692 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  27.85 
 
 		 742 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  29.27 
 
 		 753 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  27.29 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  29.06 
 
 		 684 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  26.58 
 
 		 537 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  25.8 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  24.96 
 
 		 712 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  25.38 
 
 		 707 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  30.9 
 
 		 688 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  26.13 
 
 		 688 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  25.64 
 
 		 688 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  25.95 
 
 		 688 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  25.13 
 
 		 686 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  27.26 
 
 		 695 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  30.46 
 
 		 687 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  25.95 
 
 		 688 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  25.49 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  24.33 
 
 		 686 aa  97.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.14 
 
 		 739 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>