More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1318 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  54.73 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  55.76 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  55.92 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  52.95 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  53.43 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  53.17 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 462 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.58 
 
 		 500 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.32 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  33.41 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  33.41 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  33.17 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 477 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  32.93 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.87 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  33 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  33.49 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 476 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.48 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  27.35 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.9 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.28 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  31.53 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 		 490 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.3 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.22 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  30.52 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  30.52 
 
 		 442 aa  153  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 498 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.59 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  54.25 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.3 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>