87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3569 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 166 aa  330  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  42.42 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  48.48 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  45.34 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  45.51 
 
 		 825 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  44.24 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  45.68 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  45.28 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  40.99 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  42.42 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  40.65 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  40.24 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  30.95 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  39.44 
 
 		 197 aa  97.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.87 
 
 		 516 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  41.88 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  37.27 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  34.91 
 
 		 520 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  38.1 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  35.76 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  32.91 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  30.64 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  29.7 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  36.43 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  26.83 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  26.83 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  26.83 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  25 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.07 
 
 		 592 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  27.06 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  36.45 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.4 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  38.32 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.48 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  33.14 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.23 
 
 		 589 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  28.49 
 
 		 591 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  28.28 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  29.76 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  29.27 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  29.19 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  31.18 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00070  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531908  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.65 
 
 		 599 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  40.98 
 
 		 482 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  32.64 
 
 		 470 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.75 
 
 		 593 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  32.64 
 
 		 470 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  31.68 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.16 
 
 		 591 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  39.34 
 
 		 475 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  39.34 
 
 		 475 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  39.34 
 
 		 475 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  26.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 		 470 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  23.78 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.2 
 
 		 599 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  24.85 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29775  predicted protein  29.37 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  30.16 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  40 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  24.85 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  26.38 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 478 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 470 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.88 
 
 		 592 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  24.71 
 
 		 594 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  24.12 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  24.12 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  38.18 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  24.12 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  23.49 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  24.24 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  24.22 
 
 		 292 aa  41.2  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  24.85 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  31.43 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  26.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>