More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1350 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  62.24 
 
 		 296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  61.95 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6757  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0053  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  22 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0050  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  25.16 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.34 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  26.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.52 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  28.74 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3290  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00939534  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3932  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1287  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0160  transcription regulator protein  28.11 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2994  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0265  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0660  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.641182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.56 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.88 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  36.78 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1146  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0669  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.62 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0736  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  30 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6651  transcriptional regulator, LysR family  27.44 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2226  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  26.46 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1657  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3240  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0706  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1721  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2482  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0604  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>