More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0676 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  55.87 
 
 		 598 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 596 aa  1223    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  53.02 
 
 		 596 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  42.49 
 
 		 595 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  39.79 
 
 		 596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  39.07 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  39.4 
 
 		 589 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  36.1 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  37.81 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  36.47 
 
 		 576 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  35.17 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  37.09 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  33.04 
 
 		 565 aa  356  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 593 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 		 589 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 		 610 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23.37 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 602 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 248 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  24.36 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  24.25 
 
 		 594 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30.04 
 
 		 239 aa  94.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 229 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  24.48 
 
 		 602 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  29.72 
 
 		 599 aa  87.4  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 612 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  25.57 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  31.07 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  27.38 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  23.54 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  23.93 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  21.81 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 769 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  25.66 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.66 
 
 		 753 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  27.83 
 
 		 697 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 602 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  24.09 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  29.9 
 
 		 616 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 613 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.14 
 
 		 611 aa  67  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 661 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  23.9 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 727 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  29.68 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  38.14 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  27.08 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.57 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  25.99 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  24.9 
 
 		 1017 aa  63.9  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  23.25 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  26.09 
 
 		 694 aa  63.9  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  30.23 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  23.35 
 
 		 362 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  25.57 
 
 		 1095 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  22.27 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  32.2 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  34.58 
 
 		 979 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  22.07 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 		 730 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  34.58 
 
 		 928 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  24.22 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  23.24 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  23.9 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  42.59 
 
 		 1057 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  27.56 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  34.58 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  42.59 
 
 		 1048 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  23.47 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 785 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  23.89 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  42.59 
 
 		 896 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  42.59 
 
 		 858 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  42.59 
 
 		 930 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>