More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0377 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  63.95 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  63.95 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  61.63 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  63.1 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  63.1 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  59.77 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.89 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  52.63 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  53.01 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  44.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  42.31 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.58 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.36 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>