More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3870 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 1120 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  56.41 
 
 		 773 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  53.36 
 
 		 876 aa  683    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 		 1108 aa  740    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  54.3 
 
 		 666 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 		 1073 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.19 
 
 		 1134 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  51.75 
 
 		 918 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  48.45 
 
 		 1086 aa  927    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1088 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1088 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 		 1073 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 		 1105 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  51.64 
 
 		 872 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  37.49 
 
 		 1073 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  51.08 
 
 		 914 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  100 
 
 		 1091 aa  2219    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  50.96 
 
 		 896 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.57 
 
 		 1155 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  47.43 
 
 		 1150 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  45.76 
 
 		 1126 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  56.63 
 
 		 663 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  53.17 
 
 		 1100 aa  1033    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  51.72 
 
 		 1113 aa  1053    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.72 
 
 		 1113 aa  1053    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  38.31 
 
 		 1080 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  38.96 
 
 		 1086 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  46.41 
 
 		 991 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.34 
 
 		 1104 aa  848    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 		 1105 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 		 1073 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  36.47 
 
 		 1070 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  36.82 
 
 		 1073 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  37.16 
 
 		 1070 aa  625  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  38.1 
 
 		 1088 aa  625  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  38.06 
 
 		 1082 aa  619  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  37.93 
 
 		 1082 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  37.93 
 
 		 1082 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  45.57 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  45.57 
 
 		 777 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  50.8 
 
 		 1178 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  44.43 
 
 		 1090 aa  556  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  44.15 
 
 		 1110 aa  552  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  42.38 
 
 		 1161 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.66 
 
 		 1068 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  41.52 
 
 		 1068 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 		 1091 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 		 1069 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  48.35 
 
 		 1055 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 		 1068 aa  439  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.09 
 
 		 1071 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  43.83 
 
 		 1112 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.77 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 		 1021 aa  426  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 		 1068 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 		 982 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  36.82 
 
 		 1031 aa  405  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.21 
 
 		 1082 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  43.92 
 
 		 977 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 		 1066 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  43.99 
 
 		 1125 aa  403  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  43.39 
 
 		 1003 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.23 
 
 		 1129 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  43.54 
 
 		 1087 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  42.64 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  45.73 
 
 		 1077 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.67 
 
 		 964 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 1139 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.92 
 
 		 1261 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 		 1118 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 		 1112 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  43.28 
 
 		 1084 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 1250 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.86 
 
 		 1082 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  42.62 
 
 		 1127 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.95 
 
 		 1386 aa  376  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  43.42 
 
 		 959 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  37.48 
 
 		 1130 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  46.27 
 
 		 985 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.95 
 
 		 1362 aa  373  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 		 1164 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  43.52 
 
 		 1084 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  39.58 
 
 		 1081 aa  366  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  43.08 
 
 		 1084 aa  365  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 1069 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.6 
 
 		 1110 aa  361  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 		 1066 aa  360  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.34 
 
 		 1163 aa  360  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  43.06 
 
 		 924 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.88 
 
 		 1102 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  41.2 
 
 		 1078 aa  358  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.25 
 
 		 925 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  38.92 
 
 		 1069 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 		 848 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 		 1403 aa  357  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 		 918 aa  356  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 		 933 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 1160 aa  355  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.6 
 
 		 1069 aa  355  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.09 
 
 		 1154 aa  353  8e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>