More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2960 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  35.29 
 
 		 128 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 318 aa  98.6  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  36.75 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  36.75 
 
 		 121 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 128 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 128 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  37.61 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  95.9  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 237 aa  94.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 121 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  35.9 
 
 		 121 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1651 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 121 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 121 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 231 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 121 aa  92  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 239 aa  92  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  35.21 
 
 		 236 aa  91.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  35.04 
 
 		 121 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  35.04 
 
 		 121 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.15 
 
 		 491 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  33.87 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  91.3  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  38.46 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 231 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  35.29 
 
 		 121 aa  90.9  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 295 aa  90.9  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 161 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 887 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  35.9 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  36.75 
 
 		 120 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  34.71 
 
 		 125 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  37.17 
 
 		 121 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  37.61 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 129 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  35.65 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 147 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 232 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  33.05 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 124 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>