158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2110 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  64.78 
 
 		 171 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 180 aa  97.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  25.58 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  24.14 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  23.68 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 136 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  22.55 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  22.55 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  24.73 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  30.17 
 
 		 313 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 176 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  26.53 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  26.53 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  21.57 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>