219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1339 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  100 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  70.14 
 
 
211 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  65.87 
 
 
233 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  67.94 
 
 
210 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  62.68 
 
 
212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  61.06 
 
 
210 aa  264  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  51.66 
 
 
210 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  56.25 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  47.14 
 
 
232 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  49.76 
 
 
216 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  46.89 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  38.65 
 
 
210 aa  185  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  43.27 
 
 
209 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  35.75 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  36.36 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  36.06 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  35.58 
 
 
216 aa  134  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  36.68 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.44 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  34.29 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  34.29 
 
 
215 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.01 
 
 
218 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  35.68 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  31.43 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  35.68 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  31.03 
 
 
224 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  33.18 
 
 
217 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  31.78 
 
 
217 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  32.71 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.86 
 
 
217 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  32.71 
 
 
217 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  34.27 
 
 
199 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.8 
 
 
215 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  28.44 
 
 
211 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.14 
 
 
220 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  33.17 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.83 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  30.21 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.79 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  29.63 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  30.43 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.89 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  27.48 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  30.85 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  27.03 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  27.96 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.68 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.58 
 
 
217 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  26.58 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  30.59 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  32.26 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  27.48 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  27.31 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  27.31 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  27.48 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  32.27 
 
 
217 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  27.78 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  27.78 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  30.57 
 
 
235 aa  88.2  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  28.71 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.79 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.35 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  26.91 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  32.48 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  28.77 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.87 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.87 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.87 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.87 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.46 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  26.91 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  26.17 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  28.32 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.94 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  25.87 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  26.91 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  26.54 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  24.15 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  30.19 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  29.69 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  29.91 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.97 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.6 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.5 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  27.31 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  27.07 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  23.42 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  27.91 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  30.64 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>