More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4818 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  71.03 
 
 		 268 aa  344  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  59.69 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  59.23 
 
 		 265 aa  309  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  59.69 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  57.77 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  58.04 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  50.59 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  50.2 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.4 
 
 		 280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  50.4 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 268 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  46.59 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  48.81 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.4 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  46.4 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  49.4 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  43.78 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  45.02 
 
 		 251 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 292 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  45.78 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  50.2 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50.6 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  53.75 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  45.6 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  51.79 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  48.28 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  48.02 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  45.78 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  46.43 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  45.78 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  48.21 
 
 		 291 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.06 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  44.4 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  45.82 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  46.4 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  45.2 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  46.07 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  48.28 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  47.41 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  46.43 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  46.8 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  50.79 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  46.85 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  45.02 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  44.18 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  47.27 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.18 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.29 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  44.18 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.14 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.85 
 
 		 334 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  45.21 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.83 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 		 313 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.32 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  45.56 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.32 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  47.43 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  47.41 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.04 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  43.2 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  47.43 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  44.36 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  44.8 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  44.58 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  47.45 
 
 		 612 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.49 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  44.36 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  47.49 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  45.82 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>