More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4278 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  58.1 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  51.3 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.36 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  46.65 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  47.33 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  48.34 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  47.47 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  50.49 
 
 		 334 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.33 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  44.3 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  46.2 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.57 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  50.49 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.57 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.47 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.52 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.76 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  46.33 
 
 		 698 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  50.33 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.56 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.75 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  44.33 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  43.21 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.85 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.18 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.77 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.01 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.13 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.48 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.54 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.44 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.44 
 
 		 345 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.7 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.14 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.95 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.58 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.9 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  41.74 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.51 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.27 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.59 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.94 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.36 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.55 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.5 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.25 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  43.48 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.12 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.51 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.26 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.37 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.87 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.34 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.05 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.46 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.04 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  45.28 
 
 		 326 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.05 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.38 
 
 		 304 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.27 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.45 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.32 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.93 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.84 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.41 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  43.09 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.61 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.3 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42.33 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  44.37 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.23 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.81 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.39 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  43.51 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.69 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.16 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.45 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.52 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.72 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.17 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.56 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.77 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.5 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.61 
 
 		 323 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.51 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  43.71 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>