More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3609 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  0.0172311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.47 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.47 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.41 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.41 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.11 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  37.54 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  36.21 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.85 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.91 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.57 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.23 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  39.93 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.77 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.97 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.53 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.57 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.14 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  41.55 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  41.34 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  42.12 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.05 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.38 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.99 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  35.03 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1190  hypothetical protein  39.09 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.73 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.82 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  39.94 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.31 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.08 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.94 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  37.46 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.73 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  38.81 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.9 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.48 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.13 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  36.8 
 
 		 698 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.59 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  38.11 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  36.78 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  38.65 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.92 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  37.05 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.04 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.94 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.42 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.94 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.15 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  38.05 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.08 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.7 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  38.57 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  33.11 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.15 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  37.12 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  38.33 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.89 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.29 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.64 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.58 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  32.48 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.42 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3881  hypothetical protein  38.31 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.4 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.4 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.95 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  42.24 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.31 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.21 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.16 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.31 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  38.21 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  39.1 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  38.46 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  42.32 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.45 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.16 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  38.66 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  39.02 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.32 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  39.21 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  40.75 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>