More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1190 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1190  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  48.49 
 
 
330 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.18 
 
 
336 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  44.41 
 
 
327 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 
331 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.71 
 
 
325 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  43.87 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  47.18 
 
 
334 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.61 
 
 
351 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.49 
 
 
339 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  43.93 
 
 
327 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.49 
 
 
318 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.3 
 
 
356 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.04 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.93 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.79 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.04 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.04 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.37 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  44.51 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.47 
 
 
336 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.44 
 
 
333 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  48.83 
 
 
386 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.85 
 
 
323 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.82 
 
 
325 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44 
 
 
320 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.64 
 
 
323 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  46.64 
 
 
324 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.29 
 
 
317 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.17 
 
 
322 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.67 
 
 
321 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.77 
 
 
335 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.62 
 
 
345 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.62 
 
 
345 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.53 
 
 
344 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 
358 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.69 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.95 
 
 
317 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.93 
 
 
324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.28 
 
 
339 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.76 
 
 
334 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.03 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  43.05 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.15 
 
 
324 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.28 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.28 
 
 
322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  42.09 
 
 
332 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  41.95 
 
 
319 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.57 
 
 
328 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.94 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  45.79 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.62 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.61 
 
 
321 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.49 
 
 
323 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.73 
 
 
339 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.67 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.18 
 
 
362 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.25 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.21 
 
 
333 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.91 
 
 
330 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.91 
 
 
330 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  41.03 
 
 
339 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.71 
 
 
320 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 
332 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  43.29 
 
 
322 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.39 
 
 
330 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.22 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41 
 
 
333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.94 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.41 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.23 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.48 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.09 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.14 
 
 
334 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  40.95 
 
 
316 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.52 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  40.98 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.02 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  40.95 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.56 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  41.04 
 
 
338 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.67 
 
 
325 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  41.06 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.26 
 
 
329 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.86 
 
 
326 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  40.58 
 
 
329 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.54 
 
 
353 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  40.74 
 
 
332 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.84 
 
 
333 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  41.56 
 
 
326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  41.64 
 
 
332 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  44.11 
 
 
326 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  41.53 
 
 
330 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.62 
 
 
343 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>