238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3286 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 361 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  83.38 
 
 		 361 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  83.66 
 
 		 361 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  79.44 
 
 		 361 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  79.94 
 
 		 362 aa  597  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  74.73 
 
 		 368 aa  577  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  74.24 
 
 		 361 aa  577  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  75.9 
 
 		 363 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  73.96 
 
 		 363 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  72.35 
 
 		 362 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  72.35 
 
 		 362 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  70 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  69.75 
 
 		 368 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  70.31 
 
 		 368 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  70.72 
 
 		 358 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  70.67 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  69.1 
 
 		 363 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  67.97 
 
 		 368 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  68.73 
 
 		 368 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  68.54 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  68.54 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  68.54 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  68.54 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  68.54 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  68.26 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  68.54 
 
 		 368 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  55.46 
 
 		 354 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  55.62 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  54.06 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  54.9 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  53.46 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  53.46 
 
 		 353 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  56.8 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  53.91 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  52.91 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  57.1 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  54.67 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  52.81 
 
 		 358 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  51.26 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  54.4 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  49.01 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  49.14 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  49.14 
 
 		 344 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.63 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.63 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.63 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  50.74 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  48.99 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  49.03 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 		 353 aa  322  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  48.81 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.11 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.96 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  51.12 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.45 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  42.81 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  41.8 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.63 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.31 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  36.54 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.03 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.34 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.71 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  33.51 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.51 
 
 		 264 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.44 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.26 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 		 341 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  32.86 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.74 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  31.82 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  31.81 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>