More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2828 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  72.52 
 
 		 328 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  71 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  55.31 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  53.75 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  52.52 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  51.08 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  52.02 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  50.31 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  50.31 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  49.09 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  50.64 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  50.67 
 
 		 335 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.25 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.94 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  45.31 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  41.34 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.09 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.12 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.86 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.99 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.43 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.92 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.04 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  43.25 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.66 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  41.69 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.23 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.23 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.27 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.45 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.45 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  47.46 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.2 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.04 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  44.08 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  44.26 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.41 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.7 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.57 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.06 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.58 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.34 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.79 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.58 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.79 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.77 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  39.33 
 
 		 333 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.19 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.05 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.66 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.07 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  43.29 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  44.24 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.92 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  45.49 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.53 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.02 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.47 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  44.15 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.43 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.95 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  43.08 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.76 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.69 
 
 		 332 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  42.19 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.14 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  40.12 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  44.03 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.28 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  41.72 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  39.26 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.14 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  40.19 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.93 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  40.19 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  38.77 
 
 		 338 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>