174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0310 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 572 aa  1159    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  52.1 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  46.53 
 
 		 389 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  42.34 
 
 		 397 aa  320  5e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  41.58 
 
 		 397 aa  316  7e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  41.19 
 
 		 397 aa  316  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  43.02 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  42.46 
 
 		 383 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  41.9 
 
 		 399 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  72.73 
 
 		 288 aa  279  9e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  31.93 
 
 		 453 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  30.72 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  29.8 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  29.24 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  31.39 
 
 		 393 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  46.41 
 
 		 248 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  45.25 
 
 		 242 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  45.25 
 
 		 242 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  46.93 
 
 		 245 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  44.69 
 
 		 242 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  27.79 
 
 		 480 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  27.05 
 
 		 382 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  39.89 
 
 		 250 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  38.8 
 
 		 250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  27.65 
 
 		 969 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  25.98 
 
 		 360 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  27.97 
 
 		 321 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  23.15 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  31.17 
 
 		 217 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  31.17 
 
 		 217 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  27.7 
 
 		 223 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  28.4 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  31.71 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  22.26 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 886 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  27.53 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  25.7 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  28.65 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  33.88 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  27.11 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  27.5 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  25.49 
 
 		 713 aa  67  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  26.72 
 
 		 625 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  26.14 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  26.14 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  32.19 
 
 		 238 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.41 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  31.21 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  25.49 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  27.27 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  25.49 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  25.16 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.17 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  27.42 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.91 
 
 		 887 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  27.85 
 
 		 764 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  31.91 
 
 		 887 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  31.97 
 
 		 217 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  30.07 
 
 		 227 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  23.08 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  29.84 
 
 		 897 aa  62  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  31.43 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 873 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  29.14 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  31.21 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  31.38 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  30.08 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  31.38 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  33.33 
 
 		 687 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  30.99 
 
 		 241 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  28.57 
 
 		 873 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  31.16 
 
 		 727 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1390  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  29.32 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  25.33 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  26.32 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  28.46 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1873  FMN-binding  26.55 
 
 		 692 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  27.6 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  28.64 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.46 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  29.75 
 
 		 233 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  22.58 
 
 		 222 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  30.56 
 
 		 714 aa  57  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  27.15 
 
 		 715 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 703 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  29.47 
 
 		 764 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.87 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>