52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0139 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  79.9 
 
 		 219 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  46.28 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  45.83 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  38.42 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  38.83 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  38.59 
 
 		 232 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  34.44 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  37.14 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  37.14 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  32.97 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  34.24 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  35.59 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  30.93 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  32.22 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  35.03 
 
 		 250 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  33.52 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  32.2 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.06 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  32.2 
 
 		 242 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  32.2 
 
 		 242 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  31.49 
 
 		 226 aa  94.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  29.38 
 
 		 222 aa  92  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  30.11 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  30.56 
 
 		 244 aa  87.8  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  31.11 
 
 		 248 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  30 
 
 		 288 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  30.56 
 
 		 245 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.26 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  31.25 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  27.41 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  33.33 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  28.47 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  28.57 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  27.94 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  32.48 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  26.97 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  30.64 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  34.94 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  31.54 
 
 		 652 aa  52  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  28.49 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  32.95 
 
 		 101 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  24.29 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  28.21 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  23.84 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  25.97 
 
 		 244 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  24.57 
 
 		 218 aa  42  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  24.66 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  25.74 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  32.89 
 
 		 229 aa  41.2  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>