64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2904 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  44.59 
 
 
223 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  44.59 
 
 
223 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  44.14 
 
 
223 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  41.52 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  46.26 
 
 
218 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  42.67 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  42.79 
 
 
222 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  42.29 
 
 
226 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  42.29 
 
 
226 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  42.86 
 
 
231 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  40 
 
 
241 aa  174  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  39.47 
 
 
238 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  41.23 
 
 
229 aa  168  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  42.36 
 
 
218 aa  168  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  40.17 
 
 
241 aa  165  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  38.3 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  42.4 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  39.06 
 
 
242 aa  161  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  39.06 
 
 
238 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  40 
 
 
652 aa  155  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  37.33 
 
 
229 aa  154  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  39.65 
 
 
232 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  40 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  38.6 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  36.74 
 
 
222 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  39.73 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  35.24 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  36.63 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  35.32 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  31.61 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  30.35 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  28.5 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  29.15 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  27.54 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  27.65 
 
 
1685 aa  78.6  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  29.7 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  29.7 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.57 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  27.18 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  29.22 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  26.52 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  26.22 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  26.22 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  26.5 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  28.97 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  34.46 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  25.71 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  25.46 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  28.36 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  29.61 
 
 
572 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  29.15 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  27.4 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  25.24 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  25.58 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  22.56 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.87 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.06 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  26.61 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.67 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  25.96 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.23 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  25.82 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.21 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>