65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0716 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  57.01 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  47.87 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  46.28 
 
 		 196 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  42.92 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  41.98 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  38.27 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  37.67 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  37.67 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  34.91 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  36.67 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  34.42 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  35.78 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  33.66 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  33.33 
 
 		 250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  33.83 
 
 		 250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  33.17 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  35.03 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  35.03 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  31.1 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  33.5 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  33.02 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  30.54 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.34 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.13 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  29.06 
 
 		 288 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  30.05 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  29.19 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.05 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.27 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  28.51 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  27.01 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  30.23 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  27.8 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  28.86 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  28.4 
 
 		 572 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  27.14 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  26.8 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  26.47 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  28.14 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  29.38 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  27.03 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  29.13 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  27.72 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  26.83 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  28.64 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.53 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  28.64 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  27.19 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.73 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.18 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  26.29 
 
 		 652 aa  62  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  29.21 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  26.34 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  25.12 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  28.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  26.34 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  24.76 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  23.53 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  32.98 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  32.61 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  22.66 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  21.15 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  24.52 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>