63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_80 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  98 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  50.42 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  50.42 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  46.86 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  48.54 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  45.61 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  45.8 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  38.8 
 
 		 572 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  36.4 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  36.67 
 
 		 219 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  36.76 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  36.76 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  37.31 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  33.33 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  33.8 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  31.48 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  30.54 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  30.32 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  30.09 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  31.16 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  35.59 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  29.55 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  32.65 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.06 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  27.57 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.51 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  28.99 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  26.7 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  30.09 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  28.18 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  26.94 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  26.57 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  27.98 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  27.98 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  27.98 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.15 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  28.96 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  29.95 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  25 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  26.39 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  25.51 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  26.76 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  28.71 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  25.24 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  26.01 
 
 		 652 aa  69.7  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  27.31 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  28.1 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  23.44 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  28.91 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  25.23 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  25.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  26.82 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  23.76 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  25 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  22.22 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  25.37 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  23.88 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.47 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.61 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  26.26 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  28.95 
 
 		 101 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>