66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1767 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1767  ATPase  100 
 
 
244 aa  505  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  49.2 
 
 
274 aa  244  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  44.49 
 
 
244 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  42.44 
 
 
240 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  42.31 
 
 
222 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  41.63 
 
 
223 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  39.06 
 
 
223 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  38.2 
 
 
222 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  37.97 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  38.76 
 
 
226 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  40.95 
 
 
224 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  34.34 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  34 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  36.41 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  36.41 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  31.38 
 
 
250 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  33.02 
 
 
210 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  30.54 
 
 
250 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  30.35 
 
 
227 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  30.69 
 
 
219 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  28.1 
 
 
288 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  26.25 
 
 
245 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  32.51 
 
 
217 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  31.44 
 
 
223 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  26.25 
 
 
248 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  30.7 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  32.99 
 
 
213 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  26.25 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  29.44 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  25.83 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  25.83 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  29.38 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.56 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  27.88 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  27.14 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  29.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  29.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  29.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  29.76 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  26.73 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  27.83 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  26.79 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  28.57 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.44 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  28.03 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  28.99 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  28.37 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  26.04 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  25.16 
 
 
572 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  26.67 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  24.88 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  28.36 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  35.62 
 
 
101 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  25.12 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  29.33 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  22.75 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.4 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  27.36 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  26.09 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  28.3 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  25.13 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  25.48 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.95 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.48 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  23.39 
 
 
232 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  23.38 
 
 
218 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>