62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0992 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  100 
 
 
226 aa  466  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  62.83 
 
 
226 aa  294  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  53.54 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  52.65 
 
 
238 aa  236  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  50.45 
 
 
225 aa  232  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  46.31 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  42.29 
 
 
223 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  36.28 
 
 
229 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  38.33 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  37.89 
 
 
223 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  37.44 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  40.39 
 
 
222 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  37.44 
 
 
222 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  38.01 
 
 
218 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  35.81 
 
 
224 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  39.9 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  36.49 
 
 
234 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  31.28 
 
 
221 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  37.61 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  38.36 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  38.16 
 
 
218 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  36.21 
 
 
241 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  34.91 
 
 
242 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  35.43 
 
 
235 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  35.43 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  34.53 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  32.43 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  35.47 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  34.2 
 
 
227 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  30.08 
 
 
652 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  32.04 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  30.77 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  27.88 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  28.22 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  28.22 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  28.27 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  26.67 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  34.16 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  28.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  28.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  27.5 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  28.18 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  29.21 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  28.86 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  27.72 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  28.28 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  25.59 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  26.82 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  31.88 
 
 
669 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  29.14 
 
 
572 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  28.36 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  28.79 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  24.07 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  23.98 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  22 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  23.79 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  24.29 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  24.76 
 
 
1685 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  20.96 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.67 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.14 
 
 
224 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>