More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4814 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  58 
 
 
269 aa  292  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  53.15 
 
 
283 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  50.21 
 
 
267 aa  249  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  44.58 
 
 
262 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
260 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 
254 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.62 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.9 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 
264 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.05 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.76 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.61 
 
 
236 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.61 
 
 
239 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 
264 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.61 
 
 
236 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.61 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.61 
 
 
236 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
274 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 
260 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  32.05 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  32.19 
 
 
250 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 
258 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.94 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  35.55 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.69 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
253 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
253 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.65 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.27 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
280 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.62 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 
258 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
266 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
269 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
269 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
257 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.33 
 
 
259 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
289 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.74 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 
264 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
254 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  29.32 
 
 
248 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
266 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
261 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  37.44 
 
 
262 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.68 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 
263 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
263 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
289 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 
256 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
273 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 
250 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.31 
 
 
276 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 
252 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
294 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  31.66 
 
 
264 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
251 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  31.12 
 
 
270 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 
266 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>