58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4274 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 150 aa  303  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  30.22 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  34.78 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  27.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  26.32 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  31.51 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  36.99 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  31.17 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  33.33 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  38.89 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  34.15 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  32 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  28.38 
 
 		 203 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 154 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 		 470 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2642  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 		 470 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  24.76 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.72 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  33.33 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  45 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>