More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0925 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  37.43 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 269 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 276 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1509  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 292 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 273 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 176 aa  85.1  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  29.05 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  29.5 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  29.5 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  35 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.51 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  29.71 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.89 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.89 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  29.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  29.34 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  28.14 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  28.14 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  28.14 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.88 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.03 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  31.52 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  26.35 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  27.81 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>