More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1549 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  37.39 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  37.39 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  23.87 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.88 
 
 		 269 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  25.86 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  26.99 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.24 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  25.53 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  25.81 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  25.11 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  23.94 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  23.27 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  23.22 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  26.16 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  36.89 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.62 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.45 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  30.47 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  30.47 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.17 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  22.64 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  24.34 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  32.81 
 
 		 407 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  31.91 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  26.81 
 
 		 343 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.38 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 348 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  21.36 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 399 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  23.56 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  24.52 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.79 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  21.52 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08383  polyketide synthase, putative (JCVI)  34.48 
 
 		 2476 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.9 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  29.2 
 
 		 474 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  27.66 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.61 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 400 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  20.81 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  21.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.79 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  35.8 
 
 		 395 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.84 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.29 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  22.71 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.39 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.5 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.79 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.51 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>