More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0481 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  808    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  79.69 
 
 
400 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  63.04 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  48.86 
 
 
414 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  43.73 
 
 
399 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  44.67 
 
 
403 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  44.54 
 
 
395 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  43.8 
 
 
399 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  44.42 
 
 
400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  44.42 
 
 
400 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
390 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.94 
 
 
402 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
402 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  31 
 
 
434 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  36.55 
 
 
441 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
779 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  33.33 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  28.23 
 
 
779 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  29.56 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  28.52 
 
 
407 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  25.62 
 
 
441 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  25.62 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
440 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.71 
 
 
865 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  29.43 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  27.13 
 
 
653 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.17 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  30.68 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.5 
 
 
780 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.1 
 
 
1676 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  26.12 
 
 
704 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  25.45 
 
 
631 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.9 
 
 
580 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.61 
 
 
875 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.44 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  40.91 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  34.18 
 
 
276 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  36.65 
 
 
238 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  36.65 
 
 
238 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  35 
 
 
239 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
661 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
285 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
274 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
250 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
230 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.79 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  36.13 
 
 
314 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.09 
 
 
234 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
211 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 
237 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 
237 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 
248 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  35.04 
 
 
223 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  39.53 
 
 
225 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.43 
 
 
202 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.99 
 
 
213 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.86 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.54 
 
 
237 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.79 
 
 
208 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
252 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
218 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 
242 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  33.04 
 
 
260 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  32.54 
 
 
223 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
223 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  29.03 
 
 
242 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.31 
 
 
269 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 
232 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 
237 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 
245 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
214 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
234 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  42.11 
 
 
285 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.45 
 
 
269 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 
259 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 
257 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.06 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>