139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1214 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  243  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2539  hypothetical protein  69.67 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  42.73 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1446  hypothetical protein  53.85 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  37.96 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  29.7 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  25.96 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  33.58 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  33.94 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  31.71 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.56 
 
 		 2798 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  32.08 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.9 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  32.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  29 
 
 		 261 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 		 277 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  32.82 
 
 		 274 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  31.37 
 
 		 249 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  31.68 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  31.53 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  34.95 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  34.95 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  36.54 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.87 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  30.91 
 
 		 267 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  30.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  33 
 
 		 254 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.19 
 
 		 268 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  32.26 
 
 		 286 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  27.35 
 
 		 301 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.13 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  27.45 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  27.1 
 
 		 307 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.5 
 
 		 298 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  27.45 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  26.79 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  29.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  32 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  36.62 
 
 		 294 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 		 265 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.91 
 
 		 263 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  32.08 
 
 		 287 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.18 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 		 354 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.53 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.88 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  26.36 
 
 		 260 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.34 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.27 
 
 		 275 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.27 
 
 		 275 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.65 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.36 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  33.66 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  28 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27.56 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.38 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.38 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.88 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  29.25 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  25.96 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  25.37 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.37 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  27.36 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  26.23 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  28.91 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  25.58 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.88 
 
 		 266 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.88 
 
 		 262 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.88 
 
 		 262 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>