More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5800 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 848 aa  1758    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.69 
 
 		 734 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.33 
 
 		 734 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.69 
 
 		 726 aa  706    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.77 
 
 		 725 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.58 
 
 		 729 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.81 
 
 		 726 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  48.82 
 
 		 709 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.44 
 
 		 736 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.21 
 
 		 742 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.21 
 
 		 742 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.55 
 
 		 734 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.36 
 
 		 727 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.69 
 
 		 734 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.21 
 
 		 742 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  59.5 
 
 		 714 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.44 
 
 		 730 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.72 
 
 		 726 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.17 
 
 		 694 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  43.93 
 
 		 694 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  44.67 
 
 		 693 aa  592  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.66 
 
 		 696 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.28 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.56 
 
 		 696 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.56 
 
 		 687 aa  592  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.97 
 
 		 696 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  47.25 
 
 		 675 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.57 
 
 		 683 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  45.43 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.09 
 
 		 689 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  45.28 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 		 716 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.71 
 
 		 711 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.72 
 
 		 699 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.64 
 
 		 733 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 682 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.85 
 
 		 695 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.35 
 
 		 716 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  45 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.13 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.1 
 
 		 717 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  44.87 
 
 		 722 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.95 
 
 		 689 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.2 
 
 		 689 aa  552  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  43.01 
 
 		 671 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.1 
 
 		 717 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.9 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.54 
 
 		 699 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  44.17 
 
 		 674 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.29 
 
 		 723 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.84 
 
 		 699 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.38 
 
 		 723 aa  545  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.41 
 
 		 695 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.16 
 
 		 716 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 726 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.21 
 
 		 716 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.58 
 
 		 722 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.25 
 
 		 716 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  42 
 
 		 717 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.75 
 
 		 716 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.98 
 
 		 718 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.11 
 
 		 716 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.11 
 
 		 716 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.02 
 
 		 716 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.14 
 
 		 716 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.89 
 
 		 714 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.02 
 
 		 674 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.92 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.97 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.36 
 
 		 718 aa  529  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.58 
 
 		 695 aa  524  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.94 
 
 		 718 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.75 
 
 		 672 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.71 
 
 		 711 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.51 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.15 
 
 		 677 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.55 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 714 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 714 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.99 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 714 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 714 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 672 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.71 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.61 
 
 		 680 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3616  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.44 
 
 		 682 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.751531  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.8 
 
 		 718 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.11 
 
 		 716 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  39.74 
 
 		 780 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.08 
 
 		 678 aa  501  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.5 
 
 		 655 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0332  M3 family peptidase  39.94 
 
 		 674 aa  501  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1191  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.23 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.130613  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.94 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0938  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.64 
 
 		 687 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.02 
 
 		 659 aa  489  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.89 
 
 		 715 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.96 
 
 		 697 aa  489  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>