More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0332 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  56.07 
 
 
695 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  63.24 
 
 
682 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  63.1 
 
 
682 aa  857    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.41 
 
 
672 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  48.74 
 
 
693 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.45 
 
 
696 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  62.95 
 
 
733 aa  853    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.82 
 
 
699 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0332  M3 family peptidase  100 
 
 
674 aa  1392    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.85 
 
 
694 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.29 
 
 
696 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.27 
 
 
689 aa  676    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.4 
 
 
696 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.27 
 
 
699 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.62 
 
 
696 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.12 
 
 
699 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.81 
 
 
671 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.19 
 
 
681 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  50.15 
 
 
685 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.2 
 
 
689 aa  700    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  57.1 
 
 
694 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  56.51 
 
 
695 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.21 
 
 
687 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  50.45 
 
 
689 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.81 
 
 
674 aa  630  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  48.88 
 
 
692 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.96 
 
 
672 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.11 
 
 
672 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2973  peptidyl-dipeptidase  49.41 
 
 
673 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.33 
 
 
683 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.84 
 
 
678 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 
716 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 
717 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.05 
 
 
717 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1608  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.54 
 
 
687 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000301747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.48 
 
 
727 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.18 
 
 
726 aa  531  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.56 
 
 
687 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  42.52 
 
 
780 aa  528  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.94 
 
 
848 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.03 
 
 
742 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.03 
 
 
742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.03 
 
 
742 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.72 
 
 
729 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.28 
 
 
726 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.01 
 
 
729 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.46 
 
 
726 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4267  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.94 
 
 
746 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.43 
 
 
734 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.61 
 
 
725 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.43 
 
 
734 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.73 
 
 
734 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.58 
 
 
734 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0143  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.2 
 
 
734 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.62915  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.85 
 
 
730 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.76 
 
 
728 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.7 
 
 
736 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.48 
 
 
714 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  38.39 
 
 
709 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.14 
 
 
723 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.64 
 
 
683 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.4 
 
 
733 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.35 
 
 
714 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  38.8 
 
 
722 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.85 
 
 
723 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.99 
 
 
717 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.99 
 
 
716 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.94 
 
 
722 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.54 
 
 
711 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.69 
 
 
716 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.84 
 
 
716 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.39 
 
 
716 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.13 
 
 
718 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.78 
 
 
716 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.54 
 
 
716 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.89 
 
 
718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.69 
 
 
716 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.84 
 
 
716 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.54 
 
 
716 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37 
 
 
712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.14 
 
 
712 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.16 
 
 
695 aa  438  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5074  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.93 
 
 
679 aa  439  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.29 
 
 
718 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  36.46 
 
 
671 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.96 
 
 
670 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.84 
 
 
711 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.54 
 
 
714 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.95 
 
 
677 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2313  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.26 
 
 
670 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0197787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.24 
 
 
714 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  36.94 
 
 
681 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.24 
 
 
714 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.24 
 
 
714 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.69 
 
 
716 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  36.94 
 
 
681 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  37.67 
 
 
675 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  36.94 
 
 
681 aa  425  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  36.79 
 
 
681 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.69 
 
 
718 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>